A mai község területe a török uralom alatt elnéptelenedett és Kerekegyháza puszta része lett.
A Jászkun kerület 18. századi önmegváltásakor Kerekegyháza pusztának a ma Fülöpházát alkotó negyedrészét Fülöpszállás lakói váltották meg és a továbbiakban ők birtokolták.
A 19. század végén, az önálló puszták megszüntetésekor a területet a birtokos községhez csatolták.
Fülöpháza 1948-ban alakult önálló községgé elszakadva Fülöpszállástól.
Ma a tanyasi turizmus van fellendülőben, több tanya is várja a látogatókat.
Közélete:
Polgármesterei
- 1990–1994: Pesti Józsefné (független)
- 1994–1998: Pesti Józsefné (független)
- 1998–2002: Pesti Józsefné (független)
- 2002–2006: Pesti Józsefné (független)
- 2006–2010: Pesti Józsefné (független)
- 2010–2014: Balogh József János (független)
- 2014–2016: Balogh József János (független)
- 2016–2019: Nagyné Balogh Csilla (független)
- 2019-től: Nagyné Balogh Csilla (független)
A településen 2016. október 2-án időközi polgármester-választást tartottak, az előző polgármester lemondása miatt.
